Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Zfp988F6VKC7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Zfp988F6VKC7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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