Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6619F6URP1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm6619F6URP1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm6619F6URP1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm6619F6URP1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm6619F6URP1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6619F6URP1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms