Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm21977F6U3N7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Gm21977F6U3N7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21977F6U3N7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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