Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Myo5cE9Q1F5 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Myo5cE9Q1F5 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myo5cE9Q1F5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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