Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc175E9PVB3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms