Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gcn1E9PVA8 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 1700092E19Rik-202ENSMUST00000154703 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Gcn1E9PVA8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Gcn1E9PVA8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gcn1E9PVA8 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms