Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms