Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn24D3YXJ9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn24D3YXJ9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms