Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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