Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms