Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms