Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms