Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rrn3B2RS91 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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