Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brpf1B2RRD7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms