Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm6880A3KG45 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm6880A3KG45 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms