Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Lcn6A2AJB9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Lcn6A2AJB9 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lcn6A2AJB9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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