Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Prdm12A2AJ77 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Prdm12A2AJ77 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms