Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ckap5A2AGT5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ckap5A2AGT5 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms