Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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