Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Krt27Q9Z320 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms