Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac6Q9Z2V5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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