Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn8Q9Z260 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms