Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Uso1Q9Z1Z0 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms