Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Sema6cQ9WTM3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms