Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Psmb3Q9R1P1 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms