Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Kcnip3Q9QXT8 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms