Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ChmQ9QXG2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms