Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Trappc2lQ9JME7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms