Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Col5a3Q9JLI2 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Col5a3Q9JLI2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
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Col5a3Q9JLI2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Col5a3Q9JLI2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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