Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Prg3Q9JL95 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Prg3Q9JL95 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Prg3Q9JL95 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Prg3Q9JL95 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Prg3Q9JL95 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Prg3Q9JL95 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Prg3Q9JL95 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Prg3Q9JL95 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Prg3Q9JL95 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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