Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Habp4Q9JKS5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Habp4Q9JKS5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms