Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Mrpl39Q9JKF7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl39Q9JKF7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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