Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Riox1Q9JJF3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms