Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ccl28Q9JIL2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms