Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
OtofQ9ESF1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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