Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1120-201ENSMUST00000058737 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ms4a4bQ9ES61 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ms4a4bQ9ES61 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ms4a4bQ9ES61 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ms4a4bQ9ES61 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ms4a4bQ9ES61 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ms4a4bQ9ES61 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ms4a4bQ9ES61 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ms4a4bQ9ES61 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ms4a4bQ9ES61 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Ms4a4bQ9ES61 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms