Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Syde1Q9DBZ9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms