Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Rnf6Q9DBU5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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