Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pop5Q9DB28 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms