Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Efhc1Q9D9T8 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 370.9 ms