Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gtf3c6Q9D8P7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gtf3c6Q9D8P7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gtf3c6Q9D8P7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gtf3c6Q9D8P7 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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