Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Derl3Q9D8K3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl3Q9D8K3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms