Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Jam3Q9D8B7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Jam3Q9D8B7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 677.3 ms