Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn22Q9D7U6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn22Q9D7U6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn22Q9D7U6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn22Q9D7U6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn22Q9D7U6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Cldn22Q9D7U6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn22Q9D7U6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn22Q9D7U6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Cldn22Q9D7U6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cldn22Q9D7U6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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