Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Echdc3Q9D7J9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms