Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Capns2Q9D7J7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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