Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ttc9bQ9D6E4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms