Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Hddc3Q9D114 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms