Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms