Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Q9CYI0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms